Αυτό αποτελούσε πάγιο αίτημα των διοικήσεων των Τεχνολογικών Εκπαιδευτικών Ιδρυμάτων, στο πλαίσιο της ανωτατοποίησης και της ολοκλήρωσης των ακαδημαϊκών τους χαρακτηριστικών.
Μέχρι και το 2008 τα ΤΕΙ της χώρας είχαν τη δυνατότητα να υλοποιήσουν προγράμματα μεταπτυχιακών σπουδών μόνο μέσω συμπράξεων με ελληνικά ή ξένα πανεπιστήμια. Με το νόμο 3865/2008 δόθηκε το «πράσινο φως» για την ίδρυση αυτοδύναμων μεταπτυχιακών, κάτι που αποτελούσε βασική διεκδίκηση των διοικήσεων των ιδρυμάτων και του εκπαιδευτικού κόσμου.
Με στόχο τη διαρκή βελτίωση της παρεχόμενης εκπαίδευσης, το ΤΕΙ Καβάλας συνεργάζεται με ελληνικά και ξένα πανεπιστήμια για τη συνδιοργάνωση των εξής μεταπτυχιακών προγραμμάτων σπουδών:
1. «MSc in Finance and Financial Information Systems» (συνεργασία του ΤΕΙ Καβάλας με το Πανεπιστήμιο Greenwich της Αγγλίας). Το πρόγραμμα υλοποιείται εξολοκλήρου στα αγγλικά στις εγκαταστάσεις του ΤΕΙ στην Καβάλα, ενώ τα δίδακτρα ανέρχονται σε 7.800 ευρώ
2. «Σπουδές ΝΑ Ευρώπης» (συμμετοχή του ΤΕΙ Καβάλας σε μεταπτυχιακό πρόγραμμα σπουδών του Δημοκρίτειου Πανεπιστημίου Θράκης). Το ΜΠΣ υλοποιείται στις εγκαταστάσεις του ΔΠΘ και δεν προβλέπονται δίδακτρα,
3. «Καταλύτες και εφαρμογές τους» (συμμετοχή του ΤΕΙ Καβάλας σε Μεταπτυχιακό Πρόγραμμα Σπουδών του Καποδιστριακού Πανεπιστημίου Αθηνών που υλοποιείται στην Αθήνα). Δεν προβλέπονται δίδακτρα,
4) «MSc in Environmental Technology and Management» (συμμετοχή του ΤΕΙ Καβάλας σε Μεταπτυχιακό Πρόγραμμα Σπουδών που υλοποιείται στα Πανεπιστήμια Aalborg της Δανίας, Emden της Γερμανίας και Leicester της Μ. Βρετανίας). Γίνεται αλλαγή πανεπιστημίου ανά τετράμηνο και το μεταπτυχιακό δίπλωμα χορηγείται από το βρετανικό πανεπιστήμιο. Τα δίδακτρα κοστίζουν 3.500 ευρώ ετησίως και
5) «MSc in Mediterranean Water Management and Policy under Water-Scarcity Conditions» (συνεργασία του ΤΕΙ Καβάλας με τα πανεπιστήμια του Palermo στην Ιταλία και του Damanhur στην Αλεξάνδρεια της Αιγύπτου). Το ΜΠΣ υλοποιείται στα αγγλικά και στις τρεις χώρες. Το 1ο εξάμηνο γίνεται στην Ελλάδα, το 2ο εξάμηνο στην Ιταλία και η διπλωματική εργασία στην Αίγυπτο. Τα δίδακτρα στοιχίζουν περίπου 7.000 ευρώ για το σύνολο της φοίτησης.
Το εν λόγω μεταπτυχιακό πρόγραμμα θα λειτουργήσει για πρώτη φορά το φθινόπωρο του 2011. Πρόσφατα του απονεμήθηκε ο τίτλος «Label» από τον οργανισμό «Mediterranean Office for Youth (ΜΟΥ), ο οποίος στηρίζεται και χρηματοδοτείται από τη Διεύθυνση Εκπαίδευσης και Πολιτισμού της Ευρωπαϊκής Ένωσης. Η πιστοποίηση «Label» έχει απονεμηθεί μόνο σε 41 μεταπτυχιακά και διδακτορικά της Ευρωπαϊκής Ένωσης.
